【名师讲堂】鲁炳怀教授:分子生物学在临床病原微生物鉴定中的应用

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楼主 2020-10-06 11:39:47
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鲁炳怀教授:中日友好医院呼吸与危重症科二部临床微生物与感染实验室主任医师,副教授,北京大学医学部硕士生导师。还担任中华医学会热带病与寄生虫分会青年学组委员,中国微生物学会医学微生物学与免疫学专委会真菌学组常委委员,华人药敏试验委员会(ChiCAST)委员,北京医学检验学会理事。主持科研课题5项,包括2项北京市级科研项目。在国内外发表文章53篇(其中作为第一作者/通迅作者发表SCI收录文章13篇),参加临床微生物书籍编写3部。




中日友好医院呼吸与危重症医学科二部临床微生物与感染实验室的鲁炳怀教授带来了“分子生物学在临床病原微生物鉴定中的应用”的精彩演讲。

 

在临床,如果怀疑感染的话,会根据病原来决定检测病原体的方法,常见的病原体检测方法有微生物学方法、免疫学方法和分子生物学方法。其中,微生物学法主要包括病原体的分离培养和镜检。病原体的分离培养和镜检等方法的检测靶向为病原体,优势是金标准,而劣势则是检测耗时相对较长。免疫学方法包括免疫荧光法、酶联免疫法和胶体金法等,检测靶向为抗原和抗体,优势是简便快速,劣势是抗原灵敏度较低、抗体检测窗口期长。而今天我们讲的分子生物学方法主要包括实时荧光定量PCR法等,检测靶向变成了核酸DNA/RNA,灵敏度高、特异性强等特性都是其相较其他检测方法的优势所在。

 


最近几年,分子生物学检测方法的发展突飞猛进,目前分子生物学在临床病原微生物鉴定中的应用主要有细菌,分支杆菌,病毒,真菌,支原体、衣原体,非扩增核酸技术,扩增核酸技术以及测序等。其中,测序技术也许在将来会取代很多PCR的应用,这也是中国在分子生物学技术上实现弯道超车的非常好的机会。除此之外,鲁教授还就基因芯片、实时荧光定量PCR和新一代高通量测序技术等进行了阐述,这些新技术用于微生物检测,使微生物基因组学获得了较好的发展。

 


如果大家在工作中碰到一个菌,鲁教授建议大家尝试用全基因组的方法去分析一下它的毒力、耐药基因和鉴定。拿一个微小杆菌肺部感染而死亡的患者举例,微小杆菌作为阳性杆菌毒力应该没那么强,所以鲁教授当时就做了毒力和耐药基因的相关分析,他将有趣的分析结果拿出来和我们作了分享,并表示这是以后的研究方向。

 

接着,鲁教授谈到了血流感染。对于血流感染,目前大家诟病的主要问题有两个,一是有很多感染没检测出来,二是我们报告的时间比较晚,患者如果是脓毒血症的话,传统的检测方法不能给临床一个及时的报告。随着分子生物学逐渐的广泛应用,这些问题得到了较大改善。鲁教授分享了一些厂家的血流感染分子测试,诸如罗氏、雅培等,他对罗氏的仪器印象很深,觉得他们的panel设计得很好,一次可以做十几个或二十几个病原,但是因为价格太贵,没有进入中国市场,大家可以借鉴。另外还介绍了一些在临床实验室中非常实用的产品,特异性、灵敏性都是很重要的参考因素,希望中国的本土企业能在这些方向做出自己的成绩。

 


鲁教授还就儿童呼吸道感染致病微生物、肺炎支原体血清学+PCR、呼吸道病毒和真菌感染的检测方法等问题进行了阐述。这些病毒在临床工作中并不是很常见,鲁教授建议如果大家有条件可以做培养,我们有荧光显微镜的方法去做相应的鉴定,如果没有条件的话,PCR的方法也是很好的诊断手段,对于感染性疾病来说,病原是非常关键的,如果微生物实验室的力量跟不上的话,会对整个临床诊断造成影响。

 

他还谈到了临床实验室的建立和扩张。和先进国家比如美国的实验室相比,国内的临床实验室差距在哪?通过和美国临床工作者的交流发现,我们的临床实验室和美国的差不太多,美国有的东西我们基本上都有,比较缺的领域是质谱和测序,美国的临床实验室可以自己完成简单的测序,而国内的实验室自己做测序的还比较少,大部分都会送到第三方或者科研机构去做。鲁教授希望以后有比较好的产品可以走入我们的实验室。一旦病原体诊断明确以后,会给患者带来很大的好处,尤其是很严重的感染疾病肆虐期间。希望我们国内也能有高端的产品出来,不要总是在低端产品上争的死去活来。

 


鲁教授最后总结道,传统的微生物检测方法可能永远不会被替代,只是起的作用和应用的领域会慢慢变小。的确,分子生物学的引进,质谱的引进,对微生物的发展前景,对微生物在整个临床中的位置都起到了关键的作用。他希望,在座的各位年轻同事能一起努力,把我们国内临床微生物的事业做得越来越好。


文字整理:Jay

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